Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms