Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr4P70658 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcr4P70658 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr4P70658 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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