Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms