Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms