Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufd1P70362 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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