Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4fP70194 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms