Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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