Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl23aP62751 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl23aP62751 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms