Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga11P61622 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms