Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme3P61290 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms