Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms