Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup43P59235 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup43P59235 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup43P59235 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup43P59235 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms