Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P58686 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P58686 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P58686 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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