Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa1P58281 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms