Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms