Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms