Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmoP56726 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmoP56726 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmoP56726 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms