Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms