Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Sh3bp1P55194 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Sh3bp1P55194 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Sh3bp1P55194 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp1P55194 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp1P55194 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp1P55194 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms