Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Map3k1P53349 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Map3k1P53349 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms