Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RoraP51448 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RoraP51448 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RoraP51448 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RoraP51448 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RoraP51448 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RoraP51448 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RoraP51448 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RoraP51448 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms