Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa6P50704 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa6P50704 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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