Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TspoP50637 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TspoP50637 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TspoP50637 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TspoP50637 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms