Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms