Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms