Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms