Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
InaP46660 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InaP46660 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InaP46660 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InaP46660 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms