Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms