Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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