Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cap1P40124 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cap1P40124 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms