Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms