Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab17P35292 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms