Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms