Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2aP34056 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms