Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms