Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms