Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms