Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HexaP29416 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HexaP29416 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HexaP29416 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HexaP29416 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HexaP29416 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HexaP29416 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms