Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmb9P28076 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms