Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vav1P27870 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms