Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms