Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NdnP25233 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NdnP25233 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms