Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms