Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tap1P21958 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms