Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms