Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a2P20490 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms