Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NefhP19246 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NefhP19246 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NefhP19246 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms