Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms