Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms