Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms